反复流产除与遗传、内分泌、免疫、全身状态、染色体异常及生殖道异常、子宫病变等诸多因素有关外。近年来，临床医学工作者发现，孕前和孕期感染，是引起反复流产的重要原因。
风疹病毒感染；孕妇在妊娠3个月内感染风疹病毒，会使胎盘发生水肿、纤维化、血管周围炎及绒毛坏死而致流产。在妊娠3个月后感染，会使胎儿发生病毒血症，导致播散性多器官感染，最终亦导致流产或导致胎儿畸形。
支原体感染；据研究，在反复自然流产的胎儿中，解脲支原体的平均检出率为50%-80%，它主要是通过性接触传播。由于感染了解脲支原体后会对子宫内膜产生有害的炎症反应，损害生长中的胚胎或干扰胚胎植入及干扰母体免疫系统保护胚胎的调节机制，从而导致流产。
沙眼衣原体感染；它也是通过性接触传播，据对自然流产病例的研究，在宫颈上皮细胞内找到衣原体包涵体的占43.7%。由于感染了沙眼衣原体后也会对子宫内膜产生有害的炎症反应，干扰母体免疾系统保护胚胎的调节机制，因而也会导致流产。
弓形虫感染；弓形虫是全球性畜共患的疾病，孕产妇感染率弓形虫后，能通过胎盘传给胎儿，导致流产、死胎、早产或先天畸形。由于孕妇感染弓形虫后常无特异性临床表现，要通过检测其特异性抗体才能确定，一般不易作出诊断。
其它；孕妇在胚胎期感染了人类巨细胞病毒后，会侵犯到胎儿的中枢神经系统和心血管系统，引起胚胎发育异常而致流产。孕妇感染了人微小病毒后，亦会传播到胚胎或胎儿，病毒在胎儿骨髓和肝脏中复制，导致胎儿死亡而流产。
由此可见，孕期感染与反复流产关系密切，故如果孕前发生上述感染，应积极治愈后再妊娠；如果孕期发生感染，在治疗的同时应对胎儿作产前诊断，一旦发现胎儿有异常，应立即终止妊娠。